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脱靶的CRISPR

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Unexpectedmutations after CRISPR-Cas9editing in vivo. Nature Methods
近期这篇有关CRISPR文章很火。CRISPR是一种新兴的高效低成本基因编辑技术,被认为前景广大,不可限量,以至于诺贝尔奖指日可待。
基因编辑技术的靶子是基因。
厉害的技术应该是打靶精准。这里的精准其实包含两点,一是靶子能被打中,二是不能打到靶子外的任何花花草草(这显然很不好)。
第一点CRISPR大体是满足的。
第二点似乎有点争议,还没那么明朗。
这篇文章请来了三只老鼠(兄弟姐妹siblings),对其中两只采用了常用的CRISPR技术编辑了他们一个基因,也就是打了个靶。第三只是对照组,大体没对它做什么。
作者好奇的是,在两只打靶组老鼠的基因组中,除了那个靶,还有什么花花草草,也就是基因序列,被打到了。
方法是对三只老鼠分别进行了全基因组测序,然后两只打靶组老鼠分别跟控制组老鼠的全基因组进行比较。
结果还是挺惊人了。
相对与控制组,两只打靶组都有接近1700个单位点变异(SNV, single nucleotide variant),且其中的1400个是在两个打靶组老鼠中同时发现的。作者的结论是这1400个很可能是CRISPR脱靶而引起的变异。
简单地说,CRISPR比人们原本以为的,多打到了很多很多的花花草草。
其实挺吓人的。
想一想,这技术已经(早期地)被用于人类胚胎的编辑了,同时很多人想把它用来做人类的基因治疗工作。若这是真的,那么它搞出来这么多奇怪的变异可就麻烦了。这还能用么?
不过这文章立刻引出了大量大量的争议,无数科学家震怒,单单正式的反对批评稿子就有几十篇。意见洋洋洒洒无数条。
你觉得,或者你能看出哪里有问题吗?


IP属地:中国香港1楼2017-06-14 12:11回复
    Cas9 和Cpf1那个脱钯高?


    IP属地:北京2楼2017-06-14 15:45
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      把SNP也算作cas9的锅了


      3楼2017-06-15 19:25
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        这种明显漏洞不知道怎么过的review


        IP属地:广东来自Android客户端4楼2017-06-16 02:39
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          意思是实验组的俩老鼠比控制组的那一只多了很多变异 其中大部分在俩实验组老鼠身上都发现了? 要是这样那恐怕不能看成是单纯的SNP吧?


          5楼2017-06-16 04:53
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