紫外线消毒器的消毒杀菌实际效果有时候比不上预估的很好，造成这一状况出現的缘故有许多，让我们详细解释一下什么因素会影响紫外线消毒器的消毒效果。
　　(1)紫外线消毒器的结构设计和效率
　　理想状态下的紫外消毒设备，不考虑流体动力学的影响，理论紫外剂量即为紫外消毒系统中每个紫外灯管所输出的紫外剂量之和。在污水消毒中，消毒效果是在考虑流体动力学情况下，由能被污水中微生物吸收到那部分有效紫外剂量来决定。不同的结构设计、不同的灯管排布方式、设备内部水利条件，都使紫外消毒设备的效率(即：有效紫外剂量/理论紫外剂量)不同，不同设备商的紫外消毒设备效率有较大差别，低的小于 50%，高的可达到 70% 以上。因此紫外消毒系统中所用的灯管数量不能取决于单根灯管的紫外输出能量，要考率紫外消毒设备的紫外能量利用率。
　　(2) 紫外灯管的性能及老化系数
　　紫外灯管是紫外消毒系统的重要组件。其性能不仅仅是新灯管的紫外能量输出、光电转换效率还包括灯管的老化特性。灯管在使用过程中会逐渐老化，紫外能量输出会随时间而衰减。灯管的老化系数定义为灯管在寿命周期终点时的紫外能输出与新灯管紫外能输出之比。在剂量计算时必须计入灯管的老化系数，而不能单考虑厂家对紫外灯管的保证寿命，目前市场上大多数的紫外灯管的老化系数在 50% 左右，个别厂家的灯管老化系数可达 80%左右。根据NWRI紫外协议[19]规定紫外消毒系统灯管老化系数为0.5。
　　(3) 灯管结垢系数
　　城市污水中的复杂成分加之紫外消毒设备运行时灯管表面有较高的温度，会使灯管外的石英套管表面结垢，影响紫外光的透射，直接影响系统的消毒性能。为保证系统消毒性能不受结垢的影响，在剂量计算时需考虑结垢系数。结垢系数一般与灯管的清洗方式有关。