二、摸
这是每位患者来就诊时，医生都要去做的事，指诊。在外口周围摸摸看有没有条索，看它通向哪里？再摸摸肛内，看看是不是可以摸到内口。一般的肛瘘通过“摸”就能诊断清楚了。但如果瘘管位置较深，或没有完全形成，或属于括约肌间的，摸就失灵了，这时候我们需要采取下面措施继续检查。

三、探
　　肛肠科医生都有一个重要的工具，探针，以前是铁的，后来是铜的、钢的、银的及合金的。用探针从肛瘘的外口探入，只要瘘管畅通，探针就可以一直探查到内口。手术时，沿探针把瘘管切开，一台手术就结束了。
　　用探针来定位内口需排除两种情况，瘘管中间闭塞不行，瘘管弯曲不行。

四、灌
针对弯曲的瘘管，摸不行，探针也不行，这时候我们可以从外口灌进去液体，看看从什么地方流出来，流出的地方就是内口。现在使用的液体有美兰，有双氧水。
　　使用这种方法的前提条件是，瘘管畅通。

五、照
B超、X光、CT、核磁，这些都属于“照”的范畴，尤其是B超，近年来在临床广泛应用，一些有经验的检查医生，可以准确描述瘘管的位置、范围、与括约肌的关系和内口的位置，不过必须是专用B超。
　　对深部瘘，CT和核磁有重要参考价值，但并非必须。
需要指出的是，这些物理检查都只能提供参考，因为最后都必须可以用手触之方能手术。
六、切
在以上方法都还不能定位内口的情况下，只能去切开瘘管，沿着瘢痕与坏死组织，且切且寻找了。
综上，对于肛瘘的诊断其实也要看医生的临床经验，影像学检查个人看好专科B超，核磁和ｃｔ有参考价值，但并非必须，真正需要的肛瘘不会超过10％！！！

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为什么肛瘘一定要尽早治疗？
一、大多数肛瘘开始时都是低位单纯性的肛瘘，随着病情的反复发作，脓肿的反复形成，不但经常肿胀疼痛，有脓液排出，污染内裤，给生活带来不便，同时也会形成更多的支管，变成复杂性肛瘘，更值得重视的是还会向深部发展，形成高位肛瘘，给以后的手术带来困难。
二、由于肛瘘的反复发作，形成复杂性肛瘘及高位肛瘘，病变范围不断扩大和向上蔓延，不仅肛周的瘢痕范围扩大，影响肛周括约肌的功能，造成肛门功能的下降，而且手术时还可能损伤更多的肛门内、外括约肌，甚至肛管直肠环。这样的话，创面较大，患者痛苦亦较大，不但创面的愈合时间长，也可造成因肛门周围功能肌的损伤而导致肛门功能下降，形成不同程度的肛门失禁。
三、近年来，临床上时有报道肛瘘长期不愈而癌变，这可能是由于长期的慢性炎症刺激而致使癌变。如果肛瘘恶变后，行手术治疗一般很难保留肛门，而作腹部造瘘，给患者生活带来不便，在心理上造成负担。
四、由于肛瘘有反复肿痛溃脓的可能，特别是在身体疲乏时容易发生，脓水常污染内裤，肛门潮湿不适，进而可形成肛周湿疹等肛周皮肤病，增加患者的痛苦。