在接气管前，应先将有压气体打开，利用气体的压力清除管内的灰尘及杂物，确保气管的洁净。 气管的内径必须大于或等于气马达的进气口的直径，以保证供气量。 必须及时地向油雾器中添加润滑油（20#机械油），以保证气马达的润滑。 要保证小型气动马达输出轴与驱动物（主机）的输入轴的同轴度。 主机的设计人员应根据小型气动马达的特性制订安全操作规程，以保证整个机器的安全运行。在方便的位置安装紧急停车装置，以防万一。 安装维修、保养时一定要关闭气阀，切断气源，方可进行工作。 不允许在无负荷的状态下连续高速运转小型气动马达（如需要，最好不要超过半分钟），否则会使小型气动马达寿命减少或损坏。
在供气管路和气动元件的接口处，不允许有漏气现象，以保证小型气动马达的供气质量。 小型气动马达的排气口可安装与其匹配的消音器，但不能完全堵死，否则影响小型气动马达的运转。 双向旋转的小型气动马达，其中一个进气口进气时，另一进气口即成为负排气口，决不能堵死，最好使用三位四通阀，否则小型气动马达不能正常运转。 应定时对小型气动马达进行维护清洗，更换易损件。以保证小型气动马达运转正常。 长时间没有使用的小型气动马达，可从进气口灌入少许的润滑油 （20号机械油）用手转用输出轴，再接通压缩空气，以点动的方式（30秒）使其自动对马达内部进行清洗。加油点动小型气动马达可重复进行，感觉小型气动马达运转正常后再装机。