YMAF-X68D 萨姆扎扎
在第一次联合PLANT大战中，联合军配备的MA是以流线型为主体的宇宙战斗机机体。另一方面，在第2次联合·PLANT大战中MA的开发概念焕然一新。从以前的高机动·高加速到重视重武装·高防御力的机体相继开发。基于这种新概念建造的试作MA就是萨姆扎扎。废了人型的大型机体能够搭载强力的火炮和防御兵装，对本机之后的MA开发产生影响。

重量超过500吨的大型MA，在机体后部和下部配置了大出力推进器，发挥了高机动性。还可以通过折叠脚部实现自力飞行。

YMAG-X7F 盖尔兹格
如果把萨姆扎扎比作攻击型MA的话，同时期实战配备的盖尔兹格可以说是据点防卫型MA吧。这是MS的上半身和像昆虫一样下半身的异形，比起积极的交战，更主要的目的是在特定场所进行防卫任务。实际上在位于中东地区的联合军加尔纳汉基地配备了本机。它被用作阻止扎夫特穿越苏伊士运河的盾牌，并负责防御具有重要地?//缘政..,治意义的基地。

在MS的双肩和昆虫型单元的机首部分设置了阳电子反射器光束盾。战舰的主炮也无效化了。
用MS部分机械手支持的光束炮和位于机体后方的125mm滑翔炮也可以进行战斗，不过本机的主要任务终归是据点防卫。

TS-MB1B 欧几里得
以萨姆扎扎和盖尔兹格的运用数据为基础，联合军着手开发更具实战性的MA。是兼具机动性、火力、防御力3要素的机体。这架名为欧几里得的MA以接近埃格萨斯的形状为基调，搭载了复数大型火炮和阳电子反射器光束盾，以及更大推力的推进器。由此成为全长超过50m的大型机，但机体的综合性能比现存的所有MA都高，泛用性也出色。

机体前面设置了2连装高能光束炮和7连装加特林机关炮。擅长高速移动的炮击战。
机体底面设置了大型推进器，可以在地表和水面上滑行移动。因为适应宇宙空间，也被配备在联合军月面基地。

ZGMF-X56s 脉冲
根据第一次联合PLANT大战后签订的尤尼乌斯条约，扎夫特在MS开发和拥有数量上受到了严格的限制。特别是机体保有数的限制成为了再军？》备的枷锁，不过，即使在那样的条件下，扎夫特也着手开发新机轴MS。其中被归类为第二世代系列的脉冲通过导入换装式背包剪影系统，成功获得了可应对各种战况的泛用性。
由于爆seed后飞鸟的技量，脉冲高达发挥了比肩自由高达的战斗能力。

ZGMF-10A 自由高达
在第1次联合·PLANT大战中，自由高达是为了应对即将到来的联合军决战而开发的。由于采用NJC(中子干扰消除器)，搭载了核引擎的机体在理论上获得了无限能量，成为了与现有MS划清界限的机体。但是在实战投入前夕被基拉强夺了，之后作为第3势力的主力机活跃着。在第二次联合·PLANT大战中也为了结束纷争而努力。
发挥了后发机第二世代系列无法靠近的战斗力，潜在能力之高出类拔萃

第1次联合•PLANT大战时期，反调整者结社蓝波斯菊培养了能够对抗调整者的士兵强化人生体CPU并投入实战。并且，在第2次联合PLANT大战时期，完成了改善生体CPU不稳定的强化人，作为蓝波斯菊的上部组织——logos的私兵进行战斗。史黛拉作为其中的一员，是在自然人与调整者的斗争中遭遇悲剧命运的少女。其成长经历有很多不明之处，在幼年时期就已经被送进罗德尼亚实验室接受了强化人的培养。之后，史黛拉被分配到地球联合军第81独立机群幻痛的罗阿诺克部队，被派去军械库一号展开高达强夺作战。然后，史黛拉在那个战场上遇到了成为心灵支柱的少年。
是地球联合军培养的强化人，具有匹敌调整者的身体能力和机师适应性。平时是个沉默寡言的少女，但在战斗中会露出狰狞的一面。

尼奥·罗亚诺克是在第2次联合·PLANT大战中负责地球联合军第81独立机动群幻痛的部队指挥官，因率领史黛拉等3位强化人与扎夫特的密涅瓦队展开了激烈战斗而闻名。虽然其真实面目被假面所掩盖，所有经历都不清楚，但同时拥有指挥官的灵活判断力和优秀的机师能力，部下们对他非常信赖。另外，虽然他受到参与了Logos的蓝波斯菊盟主吉布利路的意向而行动，但有时也会对自己的职务抱有疑问。在这些飘忽不定的言行背后，隐藏着尼奥自己没有察觉到的秘密。
他指挥一支由强化人编制而成的幻痛部队，用出色的手腕让密涅瓦部队吃尽了苦头。另外，他温柔对待强化人，特别是被史黛拉所仰慕。

飞鸟将成为俘虏的史黛拉托付给尼奥，但他无法违抗吉布利路的命令，史黛拉只能再次回到战场。

斯丁格、亚路是和史黛拉一起在尼奥麾下战斗的幻痛的强化人。和史黛拉一样，两人幼年时期在罗德尼亚实验室接受了培养处理和各种各样的战斗训练，长大后被分配到幻痛的罗亚诺克队。之后，在包括史黛拉在内的三人团队中，精神状态最稳定的斯丁格成为了队伍的领导，带领着好战且喜怒无常的亚路和年幼的史黛拉。在扎夫特的兵器工厂殖民地军械库一号成功进行了高达强夺作战之后，斯蒂芬成为了混沌高达的机师，奥尔成为了深渊高达的机师，登上了第二次联合PLANT大战的战场。
斯丁格和亚路是幻痛的强化人们，也是其中的主要战力，驾驶着在军械库一号从扎夫特夺取的MS，投身于和调整者的战斗中。

史黛拉有时会因为奔放的行为而让两人感到头疼，但彼此都抱着同伴的意识。

在第二次联合·PLANT大战激化的情况下，联合军高层及其背后的秘密结社Logos开始焦虑起来。因为在前大战中获得联合军系MS技术(PS装甲和携行型光束兵器等)的扎夫特正不断开发高性能MS，联合军的优势丧失了。因此，指导联合军开发具有压倒性火力和坚固防御力、单机可歼灭敌军部队的战略级机动武器。计划将命名为毁灭高达的机体投入实战，为战乱画上句号。
由于加入了各种机能造成机体大型化，所以搭载了管制用的新型OS。另外还导入了可变机构。

装备了很多实体弹/光束系兵装，也搭载了阳电子反射器的毁灭高达的开发顺利地进行着，不过产生了别的问题。由于机体操作系统过于复杂，一般机师很难操作。于是联合军让人为地强化过能力的强化人——史黛拉担任机师。由于药物依赖不断恶化，史黛拉的精神状态不稳定，在记忆操控之后，毁灭高达被托付了给她。
史黛拉和扎夫特的飞鸟关系亲密，但由于记忆操作，和他的回忆被删除了。

在以消灭大天使号为目的的“Angel Down”作战之前，PLANT最高评议会议长迪兰达尔向全世界发出了声明，战场上反Logos的时机成熟起来。然后由联合内的反Logos势力和扎夫特组成了反Logos同盟军，要求交出据守在联合军最高司令部天堂基地的Logos成员。但是联合军的Logos派不仅保持沉默，而且在答复时间的3小时前突然发动了攻击。和由MS和MA组成的守备队一起投入了5架毁灭高达，将反Logos同盟军逼到溃败的边缘。但是，以新配备的命运高达为主力的密涅瓦队的活跃使得毁灭全灭，Logos成员被逮捕
对柏林战做出一定评价的联合军秘密地开始了少量量产毁灭。其中5架被配备在“天堂基地”对抗反Logos同盟军。正因为单机也具有压倒性能力的毁灭，同型机连携攻击的战果是无法估量的。

由于天堂基地陷落，Logos成员被逮捕，但最后一个成员吉布利路逃到联合军戴达罗斯月面基地。使用基地里并设的大规模破坏兵器镇魂曲试图直接攻击PLANT本国。于是，迪兰达尔开始了以强夺镇魂曲为目标的戴达罗斯攻略战，联合军实施了有3架毁灭高达的防卫战。但是这个时候毁灭在接近战中很弱的缺点已经暴露出来，似乎无法有效地发挥其能力。
在对付远距离目标时，毁灭可以利用搭载的火器取得绝对优势。
当进入阳电子反射器内侧时，由于机动性低对应无法跟上，毁灭被单方面击破。

虽然毁灭的击破对联合军来说是一个沉重的打击，但同时也引发了预想之外的事态。扎夫特计划排除大天使号和自由高达，发动了绝密作战“ANGEL Down”。到目前为止，大天使号一方面介入局部战，另一方面在静观大规模战斗。但是，由于在柏林战中发挥了能力，所以他们认为放任不属于联合军和扎夫特的第三势力是很危险的事。而且对飞鸟来说，这个作战是为史黛拉复仇，就算两败俱伤也决心要击破自由高达。通过最大限度利用脉冲的换装机构随时更换受损的零件，将自由逼入绝境，终于将圣剑激光对舰刀刺向对方实现了宿愿。结果，大天使号暂时撤退，失去控制的联合军和扎夫特之间的对立迅速激化。
虽然基拉呼吁停战，但他的声音完全传达不到怒目圆睁的飞鸟的耳里
击败了自由高达的飞鸟，将无处发泄的愤怒转向了联合军和自然人

CE73~74，GFAS-X1 毁灭高达
地球联合军开发的MA集大成之作。MS、 MA两种形态都发挥了高度的战斗力。但由于机体管制复杂，实际上是强化人的专用机。
MA
非人形武器，在第一次联合•PLANT大战初期担任地球联合军的主力。由于在泛用性方面不如MS，逐渐从第一线消失。在第2次联合•PLANT大战中，为了追求MS以上的大火力，结果开发出了萨姆扎扎等大型试作机。
TSX-MA717/ZD 佩格蓝德
联合军开发的巨型MA。搭载了龙骑兵系统的核动力机，由通过脑改造提高了空间认识能力的3名机师来运用。除了护卫阿兹莱尔财团的工厂卫星以外，还配备在“一族”的军事要塞里。

GFAS-X1 毁灭高达
联合军在军工复合体Logos的支援下开发的机体。型号的GFAS是“Gressorial Fortress Arument Strategic（战略装脚兵装要塞）”的略称。是以单机压制据点和防御为主要目的的机体，由于其特性，要塞形态被认为是本来的形态。除了机身和背包兼兵装单元配备了多个火炮之外，还配备了阳电子反射器等，拥有极为高度的攻防力，但另一方面导致了系统复杂化，在机体制御上强化人的操纵是不可或缺的。在欧亚联邦西部的战斗之后，投入了柏林攻防战和天堂基地攻防战。

GAT-04 温达姆
第2次联合·PLANT大战中联合军的主力MS之一。是短剑L的后继机，除了拥有强袭高达以上的综合性能，再加上采用了强袭背包系统，具有匹敌扎夫特主力机——扎古勇士的综合性。根据变更强袭背包满足用途和其运用体制的确立，发挥了应对所有战术环境的多用途性。

CE73~74，GFAS-X1 毁灭高达
地球联合军开发的MA集大成之机体。MS、 MA两种形态都发挥了高度的战斗力。但由于机体管制复杂，实际上是强化人的专用机。
MA
非》人形武器，在第一次联合•PLANT大战初期是地球联合军的主力。由于在泛用性方面不如MS，逐渐从第一线消失。在第2次联合•PLANT大战中，为了追求MS以上的大火力，结果开发出了萨姆扎扎等大型试作机。
TSX-MA717/ZD 佩格蓝德
联合军开发的巨型MA。搭载了龙骑兵系统的核动力机，由通过脑》》改造提高了空间认识能力的3名机师来运用。除了护卫阿兹拉尔财团的工厂卫星以外，还配备在“一族”的军事要塞里。