本篇不管主角坐上王座或破坏王座，始终是有神魔在的，主角还是世界主宰，哪怕隐藏结局，也无法消除神魔。
复仇篇的混沌路线只把一切回归混沌，不会有神魔和王座，但是迟会诞生有神魔的新世界，纯属满足洋子的愿意，对一切没有什么影响，要有大宇宙意志和整个系统还在，哪怕洋子成功再多也不可能改变，最多是满足洋子的强烈许愿。
复仇篇的秩序路线，也跟创世路线差不多。
唯一的遗憾是多绪没有被解放。不管任何路线，多绪永远是“工具人”！洋子不过是一个被欲望（混沌）束缚的可怜工具人而已
多绪是天照的智慧，被王座选上成了引导女神（工具人），天照无法复活。
如果要是一个完结路线，主要关键就是把多绪从引导女神职责解放，再次复活成了神造魔人“天照”，不再被使命束缚，也不会被天照束缚，就是拥有“完全的多绪意识”的天照魔人，多绪还会把洋子从混沌引导女神的职责解放。
天照、月读把自己的力量交给身为须男魔人形态的主角，天照月读消失，须男融合天照月读成了“伊邪那岐”形态。
同时也有“伊邪那美”出现并且引导主角走向一个完结路线。
来到至高天打败所有路线的强敌出现（创昆和神魔被大宇宙意志控制成了至高天王座的打手们），最后来到王座，打败阿弥陀佛，阿弥陀佛留下很奇怪的一句话就完全消失了（大概是对整个系统不满，希望主角改变）。
进入天地尽头见到路西法，路西法把自己的现象力量交给主角，路西法消失了，这次没必要试炼之战。
主角得到现象力量，主角突破到更高的境界，但是终究要面对最终BOSS，就是大宇宙的意志。
主角无论打得多少次也不可能打败大宇宙的意志，哪怕得到“伊邪那美”的力量，也无法打败大宇宙的意志。
主角突然回忆各个路线的结局（本篇和复仇篇的所有路线），最后得到“众人许愿”的力量，终于打败大宇宙的意志，让大宇宙的意志认可主角，根据主角的许愿来改变整个系统，才是真正的完结。
是不是跟女神转生4F的真结局一样吗？
其实不一样，女神转生4F的真结局是有神魔和人类团结重建世界。
这完结路线的结局是没有神魔和王座的人类世界，也许有一些神魔自愿变成人类，一些神魔自行消失，人类没有创昆之力。
主角保留前世记忆，众人没有保留前世记忆，仍然过了学校生活和成长的活力，估计主角写了前世故事的小说。