健康学院于2016年5月18日正式组建，以原生物与化学工程学院为主构架，融原人文与社会科学系及原医药与健康管理学院部分专业为一体，积极助推健康产业发展。主动适应社会对健康公共服务的需求，增设健康类专业，开拓设置中医养生保健、保健品开发与管理、健康管理、早期教育等新专业，引入健康行业产业新技术、新工艺。为区域培养健康类人才，推动技术创新，助力地方健康产业蓬勃发展。
现共有8个专业，其中生物技术及应用专业始建于1983年，是生物技术类高职教育最具有特色的专业之一，该专业是国家骨干高职院校重点建设专业、江苏省示范性高职院校重点建设专业、江苏省十二五重点建设专业、江苏省高等学校特色专业，该专业教学团队被遴选为江苏省高等学校优秀教学团队。微生物技术及应用和环境监测与治理技术是江苏省十二五重点建设专业。幼儿保育专业采用了“资格证书+专业技艺”的人才培养模式，即学生经过三年的学习，具备幼儿教师资格证书或保育员证书，并通过音乐、舞蹈、书画等专业技艺技能考核，成为幼教幼保行业需要的高素质、技术技能型专门人才。为了把人才培养模式落到实处，该系建有幼儿保育综合实训室，舞蹈房，钢琴房等专业实践教学场地，同时与清河区实验小学、天津路小学幼儿园、解放军73821部队机关幼儿园等单位签署合作协议，开辟了较为广泛的校校合作，实现了教师互派、设备共享、人才共育，培养市场需要的幼教幼保人才；并实施“4+1”理实交互的教学模式，即把专业实践课和部分理实一体课的教学地点、教学方式从单一的校内教学改革为校内与校外相结合，学生每周5天学习时间有4天在校内学习理论和模拟实践，另有1天到合作单位（与专业密切相关的）实际工作环境进行专业实践，从而使学生的专业技能得到真实有效的提高。
健康学院现有专任教师32人，其中博士6名，硕士19名，教授1名，副教授6名。拥有中央财政支持建设的国家级“生物技术实训基地”、“食品生物实训基地”，教育部生物技术类师资培训基地，江苏省食品生物技术类专业人才培养模式创新基地。现有各类实验室13个，专业技能训练中心4个，实训中心5个，校外实训基地50余家，建有“江苏省食品微生物工程实验室”、“国家级职业技能鉴定所”和“全国轻工行业特有工种职业技能鉴定站”，与江苏今世缘酒业有限公司合作成立“江苏今世缘酿酒学院”。