2013版名录遵照物种2000的数据标准，每个物种包含了科学名、同物异名、别名、文献、分类系统、分布区等数据，还包括中文名和中文名的汉语拼音的内容。每条记录都列出了审核数据专家的名字。

《中国生物物种名录》2013版共收录物种及种下阶元76462个（其中物种66708个，种下阶元9754个），95362个同物异名，32327个别 名，涉及7个界、30个门、83个纲、397个目、1959个科和11731个属。与上一版本比较，增加了6000多个种及种下阶元，拉丁名总数超过了 17万个。2013版的主要变化是，动物界节肢动物门下增加了约4000个种及种下阶元，真菌界担子菌门下增加了约1800个种及种下阶元，植物界被子植 物门下增加了约250个种及种下阶元，原生动物界变形虫门下新增了约390个种及种下阶元。
物种2000中国节点参加单位会同国内外100多名分类学专家，自2008年开始，每年编辑并出版发行《中国生物物种名录》年度名录。与全球生物物种名录 的理念一样，《中国生物物种名录》（2013版年度名录）继续采取光盘和网站的形式发布数据，供广大用户免费获取和查询。