玛瑙的染色法归纳起来有以下三种：
1.将染色剂直接浸入玛瑙，然后进行加热分解，氧化或还原，生成呈色的氧化物。如要将玛瑙染成苹果绿色可用硝酸镍溶液浸泡玛瑙，然后加热，生成的氧化镍呈绿色。
2.将两种可以起化学反应生成着色剂的化学试剂，先后分两次浸入玛瑙，生成的着色剂经热处理可以分解成呈色氧化物或简单化合物。例如，染蓝绿色的方法，重铬酸钾与碳酸铵反应生成的重铬酸铵加热分解生成的三氧化二铬呈色。
3.先将一种着色剂浸入玛瑙内部，然后再用一种固色剂浸泡，让着色剂与固色剂反应产生一种难溶呈色化合物，而使玛瑙着色。这种方法不需要高温加热，生成的沉淀要求稳定性好。