最近美国国防部解密一份F-35的综合测试报告，指出国防部估计F-35项目在整个生命周期内（包括开发、生产和维护）将耗资超过 1.8 万亿美元。
报告中发现的问题包括：
F-35的自动诊断故障系统以每小时一刺的频率发出错误警报，而标准是每50小时一次。 •
F-35修复时间至少是实际需要时间的两倍，部分原因是关键部件的故障率，且关键故障相对均匀地分布在许多不同的部件上。
为了使F-35能够飞行，隐身涂层修复等维护工作经常被推迟。F-35A和F-35C都曾处于不隐身的状态下执行任务。
经过多年的补救努力，F-35A上安装的 25 毫米机关炮由于设计和安装问题仍未能击中目标。
有关F-35 抵御24个最敏感系统遭受网络攻击的能力的详细信息已被删除，但未删除的部分内容称对实际飞机脆弱性的了解有限，并敦促项目办公室提供一架允许在代表性网络威胁环境中进行全面、端到端测试的F-35。
F-35的设计目的是对抗世界上最先进的第五代战斗机，例如中国所部署的战斗机，但仅在一次试验中使用了第五代假想敌飞机。
F-35A和F-35B需要准备大量的后勤设备和备件才能部署到海外的基地或两栖舰艇上。