一、解放舰队的兴亡
1、舰队参谋长泽尼亚被降职
帝国舰队凯坦分舰队的舰队参谋长莫科·泽尼亚来到皇宫，当着皇帝沙达姆·科里诺四世的面，向伊勒朗公主求婚。皇帝当然不同意，但也不方便直接拒绝，于是命令他去行星奥塔克平息纳瓦基督徒的叛乱。事成之后再考虑他的求婚。
由于获得的军事情报有误，泽尼亚不知道奥塔克的叛军已获得当地统治家族的原子弹。叛军把帝国部队引诱到首都利约后，引爆原子弹。泽尼亚的4000多士兵仅248人幸存。
事后，皇帝当众割除泽尼亚的军衔与勋章，把他贬到查多，军衔降至上尉，让他接受公爵巴沙尔威廉·戈兰比的领导。他自然不可能再向伊勒朗求婚。另外，皇帝派遣萨德卡去平息了奥塔克的叛乱。
副舰队长塞卢是泽尼亚的好朋友。而塞卢的副官博什是个包打听式的人物，在各级政府和军队都有线人。博什向泽尼亚透露，其实皇帝早就知道奥塔克的叛军有原子弹。他故意向泽尼亚隐瞒这一情报，诱使他失败，以几千名士兵为代价，确保他不敢再向公主求婚。

2、解放舰队的崛起
莫科·泽尼亚上尉在查多到任一个月后，被公爵巴沙尔威廉·戈兰比晋升为大副，然后指挥一艘无畏舰和七艘护卫舰去一个耀星星团执行科研任务。不料，任务期间，其中一颗耀星突然产生前激波中微子爆，意味着它即将产生感生耀斑。泽尼亚命令整个舰队就地隐蔽到附近的大型天体后面去，因为暴露在耀斑下的飞船将瘫痪，里面的舰员会有生命危险。但愚忠的戈兰比不同意，宁可牺牲1800人的生命也要为皇帝收集天文数据。在争执中，泽尼亚刺死了戈兰比。现场军官全都默许泽尼亚的行为，并执行他的命令。整个舰队得救了。
由于帝国舰队里到处都是像戈兰比一样傲慢无能的贵族指挥官，因此中下层军官早就心生不满。泽尼亚和他的下属决定哗变。对于不愿意参加哗变的军人，泽尼亚只是把他们流放到偏僻的星球，不伤害他们。
泽尼亚率领无畏舰和四艘护卫舰躲藏到行星乌瑟斯。其他三艘护卫舰返回帝国舰队，散播泽尼亚的事迹。16天后，又有70艘军舰共1500名士兵来到乌瑟斯，加入泽尼亚的队伍。
泽尼亚自封为“总司令”。他的口号是“为了奥塔克的烈士！”他的舰队利用虚假的文书和适当的贿赂搭乘宇航公会的远航机在帝国境内行动。根据公会成立初期与帝国达成的协议，公会不过问帝国的军事行动，帝国也不审查公会运输的货物。
泽尼亚的舰队来到萨卢萨二号行星，又设法吸收20艘军舰及上面的低级官兵。而贵族指挥官几乎全被下属处决，只有3名平时不坏的贵族没被杀。接着，泽尼亚总司令率军来到地面，招募了50名接受过萨德卡训练，但没被萨德卡选中的战士，包括基娅·马尔迪西。
泽尼亚把自己的这支舰队命名为“解放舰队”，因为他不反帝国，只反皇帝。他的计划是弑君，然后强迫伊勒朗嫁给自己，这样他就能合法统治帝国，改革军制，把帝国军队从腐败的裙带关系和任人唯亲中解放出来。

3、解放舰队弑君未遂
根据皇帝的安排，长公主伊勒朗在沃勒克九号行星接受过多年姐妹会训练，而二公主查莉斯和三公主温西西娅仅在皇宫里接受过姐妹会训练。现在，新的安全情势出现。四公主约西法和五公主鲁吉被送去沃勒克九号行星接受为期一年的姐妹会训练。
泽尼亚总司令派遣基娅·马尔迪西和其他多人渗透进皇宫。其中马尔迪西在厨房卧底。当皇帝视察厨房时，她企图用两把飞刀刺杀他，结果伊勒朗及时推开父亲，导致马尔迪西弑君未遂被捕。当晚一共发现4名刺客，其中一人因行刺哈西米尔·芬林伯爵未遂而被反杀。
事后，伊勒朗和芬林伯爵建议皇帝以视察香料的名义去阿拉基斯避难。萨德卡的少校巴沙尔约帕蒂·科洛纳也援引《帝国宪章》77A-4–22Q条例，强制要求皇帝远离直接危险，去一个安全的地方。皇帝只能答应他们。伊勒朗陪他去阿拉基斯。不谙世事、脆弱敏感的查莉斯像两个小妹妹一样被送去沃勒克九号行星避难。
温西西娅坐镇凯坦，处理帝国公务，就像历史上的九位女皇那样，比如贝特尔·科里诺。
皇帝和芬林伯爵走后，皇宫安保松懈。马尔迪西趁机越狱，回到解放舰队。事后，原本看管她的狱卒被温西西娅处决。

4、解放舰队包围首都
温西西娅在帝国军事档案里发现，她的曾曾祖父霍鲁克·科里诺四世皇帝曾下令在所有帝国主力舰中安装可以从外部激活的自毁装置，作为防止军队叛变的保险机制。这成为她对抗叛军的法宝。
另一方面，解放舰队洗劫了奥塔克。因为萨德卡在当地平叛时，几乎摧毁多座城市。帝国、宇宙商贸促进荣誉联盟（CHOAM公司）和宇航公会趁机在当地组织重建和再殖民，积累了大量财富。解放舰队的三艘无畏舰和更多的飞船抢走当地帝国金库里的索拉里硬币和CHOAM仓库里的物资。但泽尼亚总司令亲自找到当地公会银行的代表，表明自己无意与公会为敌。公会代表随即表示公会会保持中立。
在吸收了越来越多对贵族指挥官不满的海军军官与舰艇后，泽尼亚总司令终于决定向首都进发。抵达凯坦后，又有三分之一的首都防御飞船向解放舰队投降。他们的贵族指挥官均被下级军官处决。最后，解放舰队以13艘飞船受损的代价摧毁几十艘帝国飞船，成功包围皇宫区。
然而，温西西娅向叛军飞船发出自毁信号。随着15艘解放舰队飞船相继爆炸，双方陷入僵局：泽尼亚可以一炮摧毁皇宫，温西西娅也能一键摧毁解放舰队。
为此，在CHOAM公司总裁弗兰科斯·阿鲁的主持下，温西西娅和泽尼亚在一艘CHOAM飞船上举行谈判。温西西娅提议，他俩可以结婚，这样泽尼亚也能加入皇室，实施他所希望的改革。泽尼亚表示要考虑考虑。

5、解放舰队的覆灭
在阿拉基斯，皇帝获悉解放舰队围困凯坦后，一度考虑牺牲温西西娅。不过，在伊勒朗的建议下，他同意约帕蒂·科洛纳率领萨德卡舰队回首都增援。伊勒朗同行。他本人继续留在阿拉基斯。
回到凯坦后，伊勒朗意识到莫科·泽尼亚与温西西娅都是野心勃勃的人。他俩结婚对帝国绝非好事。于是，她决定插足，指出泽尼亚是先向自己求婚的，现在她答应了。温西西娅只能选择放弃泽尼亚。
在婚礼上，伊勒朗用涂抹了贝尼·杰瑟里特触摸毒藥的手握泽尼亚的手，导致泽尼亚中毒身亡。接着，伊勒朗的男宠阿伦用贝尼·杰瑟里特的玄秘之道格斗术杀死泽尼亚的贴身警卫基娅·马尔迪西。阿伦在贝尼·杰瑟里特姐妹会学校接受过完备的训练，与伊勒朗相识后，成为她的男宠兼警卫，满足她的生理和心理需要，但绝不干涉她的生活。最后，其他进入皇宫的叛军士兵皆被萨德卡杀死。
在皇宫上空，解放舰队与科洛纳的帝国舰队爆发激烈空战。这时，宇航公会的星际向导塞雷洛率领98艘远航机赶到，宣布公会支持皇帝。解放舰队的几十艘军舰随即转向，撞向远航机。由于温西西娅已发送自毁信号，因此这些军舰在一艘远航机内外爆炸，摧毁了它。解放舰队副指挥官阿斯托普左校战死前指出，这是对公会不中立的惩罚。其余解放舰队军舰向帝国投降。
皇帝回到凯坦后，对温西西娅擅自发送自毁信号导致一艘远航机被毁很不满，但对伊勒朗的表现很满意。约帕蒂·科洛纳也被提拔为上校巴沙尔。所有投降的叛军官兵皆被处决。

二、伊勒朗公主的仁慈
帝国行星学家列特-凯恩斯的继子列特-吉和女儿查妮现已成长为十几岁的青少年。由于不喜欢本名，列特-吉给自己化名“胡罗”。像其他弗雷曼人一样，他们一心想把外来者从沙丘赶跑。胡罗、查妮和他们的朋友贾米斯在沙漠里用火箭发射器、地雷等武器摧毁了哈科南家族的扑翼机和香料工厂。
他们回塔布尔穴地不久，胡罗和查妮的母亲，即列特-凯恩斯的妻子法鲁拉就因病去世。作为草藥医生，她患病期间一直拒绝接受帝国苏克医生的救治，坚持服用传统草藥和香料。因为她认为帝国是外来者。
皇帝沙达姆·科里诺四世在阿拉基斯避难期间，胡罗、查妮和贾米斯决定刺杀他。因为他们清楚地认识到，摧毁再多的香料开采设备，也不能改变外来者统治沙丘的现状。哪怕哈科南家族被赶走，皇帝依然会派其他家族来统治阿拉基斯。但直接弑君或许就不一样了。
在沙道特梅普斯的帮助下，查妮以女工的身份渗透进皇帝下榻的阿拉肯宅邸，熟悉地形和绘制地图。
阿拉肯城内的一家酒吧是这群谋反者的接头地点。没想到，酒保是哈科南家族的线人。更没想到，哈西米尔·芬林伯爵的特务早就获得了谋反者的情报。因此，就在格洛苏·拉班企图逮捕这群谋反者时，芬林亲自率领萨德卡把胡罗、查妮、贾米斯等28名所谓的刺客一网打尽。其中有的人是无辜的旁观者。
列特-凯恩斯听闻此事后，马上赶到阿拉肯宅邸，本来想向皇帝和芬林求情，但他们正好跟着弗拉基米尔·哈科南男爵去视察香料开采业了。凯恩斯只能转而向伊勒朗公主求情。而伊勒朗正好是凯恩斯行星学报告的忠实读者，因此对他的请求很重视。
凯恩斯走后，伊勒朗公开释放这些所谓的刺客。一来，萨德卡确实没有发现证据。二来，她知道哈科南家族对阿拉基斯的残酷压迫是当地人不满的来源。所以她要展示皇室的公正与宽大，让当地人知道皇室与哈科南家族不同，尽可能让当地人只痛恨哈科南家族，不迁怒于皇室。
事后，皇帝和芬林都不完全赞同伊勒朗的做法，但也无可奈何。

三、贝尼·特雷拉克斯的新阴谋
1、领航员尸体被盗
皇帝沙达姆·科里诺四世和伊勒朗公主受邀前往交叉点参加一位领航员的葬礼。领航员通常能活几百岁，所以领航员的葬礼是很隆重的仪式。这是一万多年来，宇航公会第一次邀请外人参加领航员葬礼。
按照传统，葬礼过后，这具领航员的尸体被宇航公会秘密送到阿拉基斯的一处前香料丛上。尸体将被香料爆炸吞噬。不料，公会飞船走后，一艘神秘的飞船在香料爆炸前最后一刻偷走了领航员尸体。这一幕正好被胡罗、查妮和贾米斯看到。
在陪伴列特-凯恩斯向宇航公会交香料税时，胡罗与查妮兄妹把他们在沙漠里看到的这一幕告诉了星际向导塞雷洛。
塞雷洛表面上无动于衷，其实很不安，因为去世的这位领航员正是他的曾祖父，也是他们家族最后一位成功变异成领航员的人。塞雷洛的祖父、父母、姐妹和他本人都没有变异成功。他自己后来接受了门塔特训练，成为一名星际向导——这个职位主要负责代表公会，与皇室、CHOAM公司等重要外部势力打交道和签署协议。

2、宇航公会向弗雷曼人求助
回到交叉点后，CHOAM公司首席董事马利娜·阿鲁拜访塞雷洛，透露给他一则情报：特雷拉克斯人似乎在研究领航员的替代品。而塞雷洛本人也在阿拉基斯上空发现一颗非法的特雷拉克斯人造卫星。他命令公会的轻型护卫舰摧毁了它。
塞雷洛怀疑特雷拉克斯人在阿拉基斯有秘密基地研究领航员的尸体，因此找到胡罗、查妮和贾米斯，委托他们寻找并摧毁特雷拉克斯人的基地。事成之后将免除弗雷曼人一年的香料税。列特-凯恩斯获悉此事后，派遣几百名弗雷曼人侦察员在全球搜索特雷拉克斯人的可能藏身地。
塞雷洛把整件事向公会高层汇报后，时间女祭司推测，特雷拉克斯人未必想打造自己的太空舰队，而是企图利用领航员的预知能力在幕后操控帝国政治和经济。

3、胡罗之死
胡罗和查妮被伊勒朗公主释放后，列特-凯恩斯告诉他们，他的侦察员找到了特雷拉克斯人的秘密基地——在赤道附近。于是，胡罗、查妮、贾米斯等人奇袭这处设施，杀死外表像石头一样的变异人和4个已经成形的领航员死灵。
然而，在战斗过程中，胡罗身中许多像刺针一样的炸弹，全身被炸得布满大大小小的血窟窿，死在查妮怀里。在悲痛中，查妮与战友摧毁了整个基地，最后用护盾吸引沙虫过来吞噬这一切。
接到列特-凯恩斯的报告后，塞雷洛率领100艘远航机封锁了整个萨利姆星系，要求特雷拉克斯人解释整件事情的来龙去脉。特雷拉克斯大师吉卜利承认，这件事是某个富商资助的个人行为，研究基地也仅仅在阿拉基斯一处。他们将把所有相关文件都传给公会。
塞雷洛暂时采信了吉卜利的说法，并给出公会的惩罚措施：提高特雷拉克斯的关税50年，检查任何特雷拉克斯人的可疑货物，切断特雷拉克斯人与CHOAM公司的一些联系，把特雷拉克斯人的商业渠道转到更无利可图的行星。

译名表
人物
Shaddam Corrino IV，沙达姆·科里诺四世
Horuk Corrino IV，霍鲁克·科里诺四世
Bertl Corrino，贝特尔·科里诺
Irulan，伊勒朗
Chalice，查莉斯
Wensicia，温西西娅
Josifa，约西法
Rugi，鲁吉
Chani，查妮
Moko Zenha，莫科·泽尼亚
Wilhelm Gorambi，威廉·戈兰比
Sellew，塞卢
Bosh，博什
Kia Maldisi，基娅·马尔迪西
Count Hasimir Fenring，哈西米尔·芬林伯爵
Baron Vladimir Harkonnen，弗拉基米尔·哈科南男爵
Jopati Kolona，约帕蒂·科洛纳
Frankos Aru，弗兰科斯·阿鲁
Aron，阿伦
Serello，塞雷洛
Astop，阿斯托普
Liet-Kynes，列特-凯恩斯
Liet-chih (Khouro)，列特-吉（胡罗）
Chani，查妮
Jamis，贾米斯
Mapes，梅普斯
Glossu Rabban，格洛苏·拉班
Faroula，法鲁拉
Malina Aru，马利娜·阿鲁
Giblii，吉卜利
地点
Salusa Secundus，萨卢萨二号行星
Wallach IX，沃勒克九号行星
Arrakis，阿拉基斯
Arrakeen，阿拉肯
Residency，宅邸
Sietch Tabr，塔布尔穴地
Kaitain，凯坦
Otak，奥塔克
Lijoh，利约
Chado，查多
Uthers，乌瑟斯
Junction，交叉点
Thalim system，萨利姆星系
组织
Bene Gesserit Sisterhood，贝尼·杰瑟里特姐妹会
Bene Tleilax，贝尼·特雷拉克斯
Spacing Guild，宇航公会
Guild Bank，公会银行
Combine Honnete Ober Advancer Mercantiles，宇宙商贸促进荣誉联盟
Fremen，弗雷曼人
Navachristian，纳瓦基督徒
Sardaukar，萨德卡
Imperial fleet，帝国舰队
Kaitain squadron，凯坦分舰队
Liberation Fleet，解放舰队
头衔
Fleet Captain，舰队参谋长
Leftenant，上尉
LeftMajor，左校
Duke Bashar，公爵巴沙尔
Staff Captain，副舰队长
First Officer，大副
Commander-General，总司令
Major Bashar，少校巴沙尔
Colonel Bashar，上校巴沙尔
Princess Royal，长公主
President，总裁
Male concubine，男宠
Navigator，领航员
Starguide，星际向导
Shadout，沙道特
Mentat，门塔特
Suk doctor，苏克医生
Urdir，首席董事
Oracle of Time，时间女祭司
Tleilaxu Master，特雷拉克斯大师
其他
For the martyrs of Otak!，为了奥塔克的烈士！
Imperial Charter，《帝国宪章》
Solari，索拉里
Weirding Way，玄秘之道
Pre-spice mass，前香料丛
Heighliner，远航机
Ghola，死灵