2010年12月，方滨兴开通微博遭网友围观。2011年5月，方滨兴到武大出席活动，更曾被网友扔鞋。2011年11月，北邮互联网治理与法律研究中心网站遭攻击，页面被篡改为一个类似于“愤怒的小鸟”的游戏，游戏中的目标换成了方的头像，武器也由小鸟变成鞋子，游戏被起名为“A ngryShoes”(愤怒的鞋子)。在前述《环球时报》的报道中，方滨兴对网友的不满表示，“我将这些辱骂当做为国家作出的牺牲。”
2013年7月18日，《南方周末》发表报道《方滨兴的墙内墙外》，再次引发网友对方滨兴的争议。