部分军事史学者曾将"齐柏林伯爵"号未能服役归咎于战争进程过快,但深入分析档案显示,该航母建设受阻的核心症结在于德国空军总司令赫尔曼·戈林的权力垄断。作为纳粹政权实质上的二号人物,戈林曾公开宣称:"德意志领空内所有飞行物皆属空军管辖。"当其获悉海军多次提案建造航母以强化海上航空力量时,这位空军统帅表现出强烈抵触。他敏锐意识到:航母作为移动的海上航空基地,将使海军获得独立空中作战能力,势必削弱其对德国武装力量航空兵种的绝对控制权。因此,戈林系统性地利用其政治影响力阻挠相关计划。
根据跨军种分工协议,航母舰体由海军造舰局负责建造,舰载机研发及航空系统则由空军技术局承担。实际执行过程中,海军如期完成舰体建造工程,但空军负责的舰载机研发严重滞后。更具破坏性的是,空军技术部门一度拒绝向海军提供舰载机的关键尺寸数据,导致舰载机升降机、机库布局等核心系统设计陷入技术困境。这种通过行政手段实施的隐性干涉,最终导致"齐柏林伯爵"号航母工程于1940年陷入实质性停滞状态。
挪威战役后,鉴于奥斯陆行动中海军的损失,"齐柏林伯爵"号已安装完毕的150毫米舰炮被拆卸,用于加强占领区的海岸防御,防空火炮系统被挪作他用,火控系统的交付计划也被取消。1940年7月6日,处于停工状态的"齐柏林伯爵"号被拖曳至东部的格腾哈芬港以规避空袭威胁,在此充作浮动仓库,1941年巴巴罗萨行动前夕,该舰又转移至斯德丁,并于苏德战争爆发前夜(6月21日)安全抵达。这次战略转移旨在规避预想中的苏联空袭,待警报解除后,军舰于11月11日重新返回格腾哈芬。

至1941年末,世界战局的发展充分印证了航空母舰的战略价值:英国舰载机突袭塔兰托、参与围歼"俾斯麦"号战列舰,以及日本航母部队在太平洋战场的卓越表现,均促使德国海军加速推进航母建造计划。1942年4月16日,在希特勒大本营举行的战略会议上,海军高层对"齐柏林伯爵"号项目复工作出三项核心承诺:
第一,确保在1943年夏季前完成两套推进轴系及相关设备的安装,使航母达到25节航速,并立即开展适航性测试;
第二,鉴于空军明确表示1946年前无法为海军研发专用舰载机,决定采用现役的Ju-87C俯冲轰炸机和Bf-109T战斗机,为此需配套研发新型舰载弹射装置(参考日本方面提供的吴式四型弹射器),预计相关技术攻关需时两年,航母正式服役时间不早于1943年;
第三,空军承诺首批可提供12架战斗机和20架俯冲轰炸机组成的航空联队,并协助进行海军飞行员的选拔和舰载起降训练。
根据会议决议,海军司令部于5月13日正式下达复工令,要求基于最新作战经验对"齐柏林伯爵"号实施必要改装:将原设计的20毫米单管高射炮全面升级为四联装型号,并大幅提升弹药储备标准。由于对老旧的Fi-167型攻击机在技术层面已经落伍,难以承担鱼雷攻击与侦察任务,航空联队仅保留战斗机与俯冲轰炸机两类机型,最终配置方案由12架Bf-109T和16架Ju-87C组成,搭载总量为28架。